Nessa etapa, as propostas pedagógicas  se voltam para a formação da autonomia intelectual do aluno, oferecendo condições de inserção desse aluno no momento presente e preparação para uma atuação transformadora no momento futuro. Os eixos que norteiam o trabalho no Ensino Médio é a interdisciplinaridade e a contextualização. As disciplinas são organizadas em áreas do conhecimento:

Área de Linguagens e Códigos que abrange: L. Portuguesa e Lit. Brasileira/ Redação/Arte Visual e Cênica (1ª série)/ Ed. Física e Língua Estrangeira. Na matrícula o aluno opta por Inglês ou Espanhol cursando a disciplina que optou até o término da Ed. Básica.

 A ferramenta  principal do trabalho dessa área é o texto nas suas diversas tipologias e o eixo de Representação e Comunicação associado aos de Investigação e Compreensão e Contextualização social e histórica.

Área de Ciências Humanas com as seguintes disciplinas: Geografia, História Filosofia (1º ano) e Sociologia no 2º ano.  A ferramenta principal dessa área é a contextualização histórica, social, filosófica, sociológica. A área faz interface com os eixos de Investigação e Compreensão e de Representação e Comunicação.

• Área de Ciências da Natureza e Matemática composta pelas seguintes disciplinas: Biologia/Física/Química e Matemática. Essa área tem como eixo principal a Investigação e Compreensão e integra no trabalho os  eixos de Representação e Comunicação e Contextualização social e histórica.

A linguagem permeia o trabalho de todas as disciplinas. Assim, o aluno é estimulado a ler o mundo de forma competente,a escrever com clareza, consistência e coesão (competência lingüística). Os fatos do mundo contemporâneo são debatidos em sala e o saber “pesquisar” exigido de forma mais  criteriosa. Considerando o Projeto Pedagógico do Colégio Vilas que começa desde o Ensino Fundamental I até o Ensino Médio mantêm-se dentro da perspectiva da formação integral do aluno com uma sólida transmissão de informação. Por formação integral entende-se a vivência constante do conjunto de valores e princípios sobre os quais a escola está assentada, numa discussão/reflexão com direção e sentido sempre voltados para a construção da pessoa, do cidadão e do meio social em que o aluno vive. Na ponta da informação, opta-se pelo cunho generalista do curso, evitando a especialização. O Colégio Vilas acredita que o jovem e a jovem devem ter a oportunidade de iniciar-se em todos os aspectos do patrimônio científico e cultural acumulado pela humanidade, confirmando assim a preocupação anterior com a formação integral da juventude que lhe é confiada. As avaliações, como nos demais níveis de ensino são realizadas de forma contínua e processual através de mini-testes e testes discursivos, avaliações objetivas,de proposições, interdisciplinares, relatórios de pesquisa e de  trabalhos em grupos etc.

O Ensino Médio do Colégio Vilas traz com  ineditismo o trabalho interdisciplinar de Filosofia e Redação (1º ano) e Sociologia e Redação no 2º ano. Esse trabalho objetiva ampliar a análise crítica dos nossos alunos, enriquecendo e aprofundando  suas produções textuais através de uma leitura fundamentada do mundo e das relações sociais, filosóficas, políticas, econômicas e de valores que permeiam a sociedade em que vivemos.